Fu fondata nel 1230, al tempo dell’altro convento di S. Francesco, e fu, in origine, dedicata a S. Antonio Abate; dopo la beatificazione di S. Antonio da Padova, fu a lui dedicata; il convento apparteneva ai Padri Conventuali; l’8 settembre del 1694, fu danneggiata gravemente da un terremoto, e fu restaurata a cura di Padre Antonio Dell’Aversana.
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Nel 1805, crollò una parte del muro e vi fu posta l’edicola di S. Antonio, che ancora oggi esiste al corso Umberto I.
Nel 181°, in seguito alle leggi di soppressione, fu utilizzato per alloggi militari. Nel 1840 fu restituito ai Padri Conventuali. Nel 1862 vi fu istituito il Ginnasio e successivamente fu utilizzato per l’Asilo Municipale, tenuto dalle Figlie della Carità, che tuttora esiste.
Nella Chiesa vi sono pregevoli dipinti tra cui un S. Antonio di Padova (sotto il soffitto) e un S. Antonio Abate.